Yomiuri Giants (1955-1959)

Mặc dù Baba gia nhập Yomiuri Giants vào năm 1955 nhưng ông không chơi trong mùa giải đầu tiên với đội theo lời giới thiệu của Shigeru Mizuhara. Baba rớt xuống đội thứ hai trong năm đầu, nhưng cuối cùng đã ra mắt vào năm 1956 và thi đấu tốt, thắng 12 trận và chỉ thua 1 trận trong năm tân binh của mình và 13 trận thắng và 2 trận thua năm 1957. Cả hai năm, Baba giành giải Nippon Professional Baseball của giải bóng chày chuyên nghiệp. Mặc dù thành công, Baba gặp vấn đề về thị lực vào năm 1957 và buộc phải nghỉ đấu để phẫu thuật khi phát hiện mình bị u não. Baba đã trải qua phẫu thuật cắt sọ tại Bệnh viện Đại học Tokyo vào ngày 23 tháng 12 năm 1957. Khi đó, tỷ lệ thành công là rất thấp và các bác sĩ đã cảnh báo Baba rằng ông có thể mất thị lực hoàn toàn, nhưng ca phẫu thuật đã thành công và Baba xuất hiện sau một tuần. Ông trở lại khi đeo miếng băng trên đầu vào tháng 1 năm 1958. Baba chơi thêm hai mùa giải, giành giải người ném bóng giỏi nhất lần ba năm 1959. Tuy nhiên, sau khi Hideo Fujimoto, một huấn luyện viên có quan hệ với Baba rời đội, và Baba cũng không chơi cho Yomiuri sau năm mùa.

Taiyo Whales (1960)

Fujimoto rời Taiyo Whales và mời Baba tới trại huấn luyện cốt để ký hợp đồng với anh ta vào năm 1960. Tuy nhiên, Baba được Goro Taniguchi mời thử việc và được thuê, yêu cầu ông chuyển đến Kawasaki, nhưng, chỉ vài ngày sau khi di chuyển, Baba ngã trong phòng tắm tại khu căn hộ mới của mình và đâm thẳng vào cửa kính vòi hoa sen. Kết quả là Baba phải khâu 17 mũi ở khuỷu tay trái và mất cảm giác một lúc. Mặc dù chấn thương không nghiêm trọng, nhưng Baba quyết định rút lui khỏi môn bóng chày chuyên nghiệp ngay sau đó và trở lại Niigata.